2022年8月10日,病原生物學研究所崔勝研究員團隊等在Nucleic Acids Research《核酸研究》雜志在線發表了題為“Biochemical and Structural Characterization of Hepatitis A Virus 2C Reveals an Unusual Ribonuclease Activity on Single-Stranded RNA”(生化和結構研究揭示了甲型肝炎病毒2C蛋白對單鏈RNA的核糖核酸酶活性)的研究論文。
迄今為止,甲型肝炎病毒(HAV)仍然是引起病毒性肝病的主要病原體之一。HAV是小RNA病毒科(Picornaviridae)的獨特成員,是肝炎病毒屬中唯一的病毒。因此,HAV在病毒分子進化方面具有重要的研究價值。
本研究團隊解析了HAV 2C蛋白2.2 ?分辨率的晶體結構,HAV 2C包含一個典型的ATP酶結構域、一個類似腸道病毒2C蛋白鋅指結構(ZFER)以及一個C末端螺旋結構域(PBD)。與其他小RNA病毒2C類似,HAV 2C通過PBD-Pocket相互作用發生自我多聚。基于HAV 2C結構,利用ATP酶實驗、BLI和HAV復制子等實驗體系,研究團隊系統研究了ATP酶、Pocket、PBD和ZFER結構域對2C活性以及病毒復制發揮的作用。發現HAV 2C不僅具有ATP酶活性,還具有核糖核酸酶(RNase)活性。HAV 2C能夠降解多種RNA底物,包括3’和5’末端突出的雙鏈RNA、單鏈RNA以及泡狀雙鏈RNA,但不降解DNA。此外,HAV 2C的核糖核酸酶對單鏈、多聚尿苷酸底物表現出偏好性。通過體外突變實驗和HAV復制子,研究人員找到了2C核酸酶活性中心及關鍵氨基酸,證明了核糖核酸酶與ATP酶無關聯,敲除核糖核酸酶活性嚴重損害HAV的復制效率。研究團隊還發現EV71 2C、PV 2C、CVB 2C、FMDV 2C、EV-D68 2C和HRV 2C等一系列小RNA病毒2C均具有類似活性。核糖核酸酶活性在小RNA病毒復制中扮演的角色尚需在后續研究中闡明。
圖. HAV 2C的晶體結構、保守結構域及其在ATP酶活性、病毒復制中的作用
該研究得到了中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程(2021-I2M-1-043)、國際基因工程與生物技術中心合作研究計劃(ICGEB-CRP)(CRP/CHN19-02)和國家自然科學基金(82072291,81772207,81572005)等項目的資助。中國醫學科學院病原生物學研究所崔勝研究員和德國海德堡大學Volker Lohmann教授為本文的共同通訊作者,崔勝課題組博士研究生陳埔、瑞士光源Justyna Wojdyla博士、海德堡大學博士研究生Ombretta Colasanti和崔勝課題組助理研究員李智劍為本文的共同第一作者。
論文鏈接:https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkac671/6659853?searchresult=1