北京協和醫學院成立于1917年，建校之初即確立了“在中國創辦世界一流醫學院”的目標，是我國現代醫學教育的發源地，開啟了我國8年制醫學教育和高等護理學教育的先河。在中國現代醫學的各個領域，協和人或成為奠基人，或成為開拓者，在我國醫學教育領域具有特殊的地位和獨特的社會影響力。協和醫學院的辦學特色鮮明，一直堅持“高進、優教、嚴出”的培養模式，以培養具有真才實學、學風嚴謹、醫德高尚、醫術精湛的醫教研復合型人才而聞名，不僅造就了林巧稚、黃家駟、吳階平等中國醫學界的泰斗，還培養了一大批享譽國內外的著名臨床醫學家、醫學科學家、醫學教育家、護理學家和醫政管理家，在國內外享有很高的聲譽。
中國醫學科學院1956年成立，自1957年起和北京協和醫學院實行院校合一的管理體制。作為我國最高醫學研究機構和最高醫學教育機構，院校自成立以來始終以引領我國醫學科技教育發展和維護人民健康為己任，為我國醫學衛生健康事業的發展做出了重要貢獻。2016年，習近平總書記在中國醫學科學院建院60周年之際，提出院校要“抓住機遇，迎難而上，努力把中國醫學科學院建設成為我國醫學科技創新體系的核心基地”的殷切期望。
醫科院與醫學院實行院校合一的管理體制，校為院之肇始，之主體，之文脈，之核心，之未來；院以雄厚的科研實力和國家級科研平臺支撐學校，保持校之科技前沿性，為校之依托。院校目前擁有19個研究所、6家附屬醫院、9個學院、106個院外研發機構，是國家醫學研究和教育事業先進的思想源和強勁的動力源。
