為貫徹落實習近平總書記“抓住機遇、迎難而上，努力把中國醫學科學院建設成為我國醫學科技創新體系的核心基地”重要指示精神，中國醫學科學院秉承創新發展戰略，服務健康中國戰略，科學謀劃、創新機制，通過整合國內外優勢研究力量，逐步構建起學科齊全、布局合理、交叉融通、互補協同、富有活力的開放型國家醫學科技創新體系。
截至2024年12月31日，院校體系內建立各類科研平臺基地185個。其中，國家級31個，包括：全國重點實驗室11個（牽頭建設8個，參與建設3個），國家臨床醫學研究中心5個，國家科技資源共享服務平臺4個，國家技術創新中心1個，其他國家科研基地10個；省部級總數69，包括：國家衛生健康委重點實驗室7個，教育部重點實驗室/工程研究中心5個，以及國家藥監局、中醫藥管理局、工信部等其他部委以及北京市、天津市、四川省、江蘇省、云南省等各省市設立的重點科研基地平臺57個；院校級87個，包括：中國醫學科學院內設研究中心28個，中國醫學科學院重點實驗室59個。
同時，針對院校體系內缺、弱及急需發展學科，聯合國內優勢研究力量，合作建設院外研發機構105個，包括：研究院/研究基地3個、創新單元94個、研究中心4個和工作站4個。另外，受國家衛生健康委委托，負責102家國家衛生健康委重點實驗室的日常管理工作。
建設開放型醫學科技創新體系是提升醫學科技創新能力的助推器，是維護人民生命健康的壓艙石。中國醫學科學院將以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，牢固樹立人民至上、生命至上理念，堅持面向世界科技前沿、面向經濟主戰場、面向國家重大需求、面向人民生命健康，以改革創新為動力，加快推進開放型醫學科技創新體系建設，為國家衛生健康事業發展做出應有的貢獻。
