2020年10月30號，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究中心蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所吳愛平課題組在《Briefings in Bioinformatics》發(fā)表了“Compositional diversity and evolutionary pattern of coronavirus accessory proteins”論文。該研究開發(fā)了一個半自動的冠狀病毒基因組組成注釋工具CoroAnnoter，系統(tǒng)解析了所有冠狀病毒附屬蛋白的多樣性組成和進(jìn)化模式。
新冠病毒（SARS-CoV-2）是繼SARS病毒（SARS-CoV）和MERS病毒（MERS-CoV）后第三種導(dǎo)致人類嚴(yán)重疾病的冠狀病毒。如此多樣的致病性冠狀病毒的出現(xiàn)，也提醒人們有必要去系統(tǒng)探索冠狀病毒群體的基因多樣性組成，特別是毒株間差異顯著的附屬蛋白的組成圖譜和分子進(jìn)化關(guān)系。本研究開發(fā)了一個半自動的冠狀病毒注釋工具CoroAnnoter，并應(yīng)用于39種冠狀病毒代表株的基因組結(jié)構(gòu)注釋。研究表明，不同類型冠狀病毒毒株的附屬蛋白個數(shù)差別巨大，介于1-10個之間，其中SARS-CoV-2和SARS-CoV具有最多的附屬蛋白，分別為9個和10個。附屬蛋白在冠狀病毒的四個屬（α、β、γ和δ）中具有顯著的屬內(nèi)保守性和屬間多樣性。本研究不僅提供了一個冠狀病毒基因組標(biāo)準(zhǔn)化注釋工具，還為冠狀病毒附屬蛋白的組成和進(jìn)化研究提供了一個綜合參考圖譜，為冠狀病毒的功能多樣性研究提供了有效支持。
圖：冠狀病毒附屬蛋白組成圖譜
本研究工作得到中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程(2016-I2M-1-005)，國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2016YFD0500301)，國家自然科學(xué)基金(31900472)等項(xiàng)目的資助。蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所吳愛平研究員為論文通訊作者，商敬哲博士為論文的第一作者。
論文鏈接：https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbaa262/5943788
