2019年10月3日,蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所蔣太交課題組與中南大學(xué)林戈課題組、深圳華大生命科學(xué)研究院徐鳳萍課題組共同合作在CellStem Cell雜志在線發(fā)表了題為Single-cell transcriptome analysis ofuniparental embryos reveals parent-of-origin effects on human preimplantationdevelopment的研究成果,闡釋了父母源基因組對著床前胚胎基因組激活(EGA)和細(xì)胞分化的作用。
該研究團(tuán)隊(duì)以人孤雌(PG)、孤雄(AG)和正常受精胚胎(BI)為模型,結(jié)合胚胎延時成像技術(shù)和單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù),系統(tǒng)地研究了父母源基因組對早期胚胎發(fā)育的影響。通過整合分析胚胎單細(xì)胞基因組、轉(zhuǎn)錄組和甲基化數(shù)據(jù),該研究團(tuán)隊(duì)首次構(gòu)建了人類單親和雙親胚胎著床前發(fā)育時期的轉(zhuǎn)錄組和DNA甲基化圖譜,并鑒定出1388個父母源基因組特異性表達(dá)基因,闡釋了父母源基因組對著床前胚胎基因組激活(EGA)和細(xì)胞分化的作用。該研究為理解人類早期胚胎的父母源效應(yīng)及調(diào)控機(jī)制,提供了翔實(shí)的數(shù)據(jù)和嶄新的思路,是對胚胎發(fā)育父母源調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的重要補(bǔ)充和完善,將為早期胚胎發(fā)育異常的溯源分析提供堅(jiān)實(shí)的理論依據(jù)。蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所蔣太交課題組承擔(dān)了主要生物信息分析工作。中南大學(xué)林戈研究員、深圳華大生命科學(xué)研究院徐鳳萍博士和蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所蔣太交研究員為本文通訊作者,冷麗智博士(中南大學(xué))、孫繼亞博士(蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所)和黃晉榮博士(深圳華大生命科學(xué)研究院)為本文共同第一作者。該研究同時獲得了中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目(項(xiàng)目編號2016-I2M-1-005)的大力支持。
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文|蘇州系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究所
編輯|王京 審校|齊翼