醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程

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【醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目進(jìn)展快報(bào)第30期】

【快報(bào)第30期】皮膚病研究所劉維達(dá)教授團(tuán)隊(duì)針對(duì)皮膚癬菌基因組學(xué)研究取得新進(jìn)展

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皮膚病研究所真菌科劉維達(dá)教授團(tuán)隊(duì)基于基因組特點(diǎn)的種系進(jìn)化進(jìn)行分析揭示了紫色毛癬菌(T.violaceum)與紅色毛癬菌(T.rubrum)臨床致病差異,相關(guān)研究結(jié)果以題為“Phylogeny of dermatophytes with genomic character evaluation of clinically distinct Tricho- phyton rubrum and T. violaceum”的研究論文于2018年2月在線發(fā)表于著名真菌研究雜志Studies in Mycology(影響因子14.00)。

紅色毛癬菌和紫色毛癬菌是引起皮膚感染的兩大主要真菌。臨床發(fā)現(xiàn),紅色毛癬菌主要感染皮膚和甲,而紫色毛癬菌更易感染頭皮和毛發(fā)。兩者的系統(tǒng)進(jìn)化特點(diǎn)極為相似,但表型差異較大。闡明紅色毛癬菌與紫色毛癬菌的致病差異機(jī)理是醫(yī)學(xué)真菌研究的重要問(wèn)題,具有重大理論及潛在臨床應(yīng)用價(jià)值,然而,迄今為止這是一個(gè)未解之謎。

在本研究中,劉維達(dá)團(tuán)隊(duì)占萍博士對(duì)紅色毛癬菌與紫色毛癬菌進(jìn)行全基因組測(cè)序,并與數(shù)據(jù)庫(kù)的皮膚癬菌測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行比照,同時(shí)對(duì)粘附素與分泌型蛋白酶等致病因子進(jìn)行預(yù)測(cè)以及進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,親土皮膚癬菌的種間進(jìn)化差異較顯著,親人和親動(dòng)物皮膚癬菌種間進(jìn)化差異較小;紅色毛癬菌與紫色毛癬菌基因序列相似度達(dá)99.38 %,紫色毛癬菌較紅色毛癬菌有更多旁系等位基因。預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),皮膚癬菌存在30個(gè)粘附因子相關(guān)基因,紅色毛癬菌和紫色毛癬菌存在17個(gè)粘附因子基因,紅色毛癬菌存在4個(gè)特異粘附因子基因,紫色毛癬菌存在8個(gè)特異粘附因子基因。多基因位點(diǎn)系統(tǒng)計(jì)劃分析和基因組對(duì)比來(lái)看,紅色毛癬菌與紫色毛癬菌具有高度的親緣關(guān)系。最后文章指出,紅色毛癬菌與紫色毛癬菌可能是同一種菌,其表型的差異可能是由于在不同體表位置而表現(xiàn)不同。這是一種嶄新的發(fā)現(xiàn),對(duì)紅色毛癬菌與紫色毛癬菌的認(rèn)識(shí)和研究引入新境界,具有重要的理論指導(dǎo)意義。

劉維達(dá)教授團(tuán)隊(duì)占萍博士(第一作者)目前工作于江西省皮膚病專科醫(yī)院。阿姆斯特丹大學(xué)生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)研究所G.S.de Hoog教授合作參與了該項(xiàng)研究。該研究獲得中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程(2016-I2M-3-021)、國(guó)家自然科學(xué)基金委的資助(31600120)及科技部基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)(2013FY113700)支持。         

 論文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166061618300071

 

 

(皮膚病醫(yī)院)